怀孕48天有褐色分泌物是少许阴道出血，一定要及时去医院做检查。如果月经比较规律，可以做B超检查，确定宫腔内是否有妊娠囊及胚芽、胎心。如果没有看到胎心就要查血HCG，看是不是水平比较低，也有可能是受孕比较晚，尤其是月经不规律的人，可能性会比较大，这种情况可以观察再复查。
另外，还有宫外孕的可能，做B超宫内、宫外都看不到孕囊，可以结合HCG及孕酮水平，过几天再复查。如果不是宫外孕，怀孕有出血可以进行保胎，或者顺其自然观察，如果是宫外孕需要及时住院治疗。