单磷酸阿糖腺苷主要是抗病毒的药物。可以用于病毒性感冒或者是病毒性的疱疹等病症。例如单纯性疱疹，带状疱疹，小儿手足口病，或者是儿童水痘等。另外与其有相似作用的药物有伐昔洛韦，阿昔洛韦，利巴韦林也就是病毒唑等。主要对抗单纯性疱疹病毒，也是最易产生的病毒感染。如果是皮肤有疱疹，可以在注射单磷酸阿糖腺苷的同时，局部涂布阿昔洛韦，效果更佳。