格林-巴利综合征是一种自身免疫性疾病。
免疫抑制治疗主要用于急性期，首选丙种球蛋白。如果患者没有丙种球蛋白过敏史，或先天性IgA缺乏症和其他禁忌症，可以使用这种方法。关于激素治疗，国外的一些临床试验已经证实，单用糖皮质激素并不是很有效。
由于我国经济和医疗条件的限制，一些患者不能接受丙种球蛋白或血浆置换治疗。部分医院还使用糖皮质激素治疗格林-巴利综合征，疗效有待进一步探讨。
急性期还可给予大量的B族维生素、维生素C等。对于呼吸困难的患者，应早期气管插管，呼吸机辅助呼吸，并提倡对患者进行早期康复治疗。