1、原发性甲减：由于甲状腺腺体本身病变引起的甲减，占全部甲减的99%。其中90%以上原发性甲减是由自身免疫、甲状腺手术治疗所致。
2、中枢性甲减：由下丘脑和垂体病变引起的促甲状腺激素释放激素，或者促甲状腺激素合成和分泌减少所致的甲减。
3、继发性甲减：常常继发于其他疾病或者其他因素，例如甲状腺手术切除或放射性碘治疗而致甲状腺组织破坏过多，抗甲状腺药物及碘化物摄入过量抑制了甲状腺机能，但一般均是可逆性的。