睡眠呼吸障碍综合征的治疗方法包括危险因素的治疗、经鼻持续正压气道通气治疗，以及手术治疗。危险因素的治疗包括减肥、戒烟等危险因素的干预，睡前不要过于兴奋，避免过饱饮食，侧卧位睡眠，不服用镇静安眠药等，有助于症状的改善。
经鼻持续正压气道通气是治疗中重度患者的主要措施，患者可给予呼吸机进行治疗，能保持上呼吸道通畅，避免塌陷或者阻塞。手术治疗用于患者有气道机械性狭窄等疾病，严重阻塞，症状较严重，暂停60次/h以上的患者，可以行气管切开术，建立旁道通气。