1、血常规：白细胞计数可高达20×10^9以上，且以中性粒细胞为主。
2、影像学检查：
（1）腹部X线平片可见肠积气但无液平，肠轮廓亦不规则，有时可见广泛而显著的指印征，有时仅局限于一节段。
（2）气钡灌肠双重造影显示肠黏膜紊乱，边缘呈毛刷状，黏膜表面可见许多圆形或不规则结节状阴影。
（3）CT扫描可见肠壁增厚、皱襞增粗。
3、内镜检查：黏膜水肿、充血、白色斑点状假膜，或者许多斑块状、地图状假膜，呈黄色、黄褐色或黄绿色。
4、粪便检查：粪便或者肠内容物细菌涂片发现明显菌群失调，或者培养出大量真菌、难辨梭状芽胞杆菌(毒素鉴定为致病菌)等。
5、组织活检：可见肠黏膜炎症细胞浸润、出血和上皮细胞坏死、假膜形成等。