运动神经元病的确诊主要靠病理检查，部分患者还需要基因检测，但是在临床实践中由于各种原因，进行病理检查的患者数量非常少，大部分都是临床诊断。
运动神经元病的患者主要表现为四肢无力、肌肉萎缩、言语不清、饮水呛咳、吞咽困难等，体检可以发现腱反射亢进、肌张力增高、病理征阳性等，肌电图检查可见神经源性改变。由于运动神经元病的临床症状表现不特异，早期容易误诊。