肉毒素中毒主要表现为突然发病，以神经系统症状为主。早期症状较轻，主要表现为眼部症状有视力减退、视物不清、眼睑下垂、瞳孔扩大等，伴有头晕、头痛、乏力、食欲不振、恶心、呕吐、腹胀、腹痛、腹泻、步态不稳等。
病情加重后，可出现咽部、颈部肌肉、面部肌肉麻痹无力、头下垂、肢体软瘫、睁眼困难、吞咽困难、呼吸困难，泪腺、汗腺、唾液腺分泌减少。
严重者因呼吸衰竭、感染导致死亡。