藿香正气口服液和藿香正气水是有区别的。它们是同一种药物的两种不同剂型，其功效相同，但是成分有所不同。藿香正气水中含有酒精，而藿香正气口服液则不含酒精，口感较好，更易入口。
藿香正气口服液和藿香正气水都是由苍术、陈皮、厚朴（姜制）、白芷、茯苓、大腹皮、生半夏、甘草浸膏、广藿香油、紫苏叶油等10味药组成。具有解表化湿、理气和中的功效。临床用于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的感冒，症见头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻；胃肠型感冒见上述证候者。
需要注意的是，藿香正气水中含有酒精，患者服用时，千万不可与头孢菌素类药物，以及甲硝唑、替硝唑等药物联合使用，以免出现双硫仑样反应。双硫仑样反应通常会出现颜面潮红、头痛、恶心、呕吐、心悸等症状，严重的会引起休克、惊厥、急性肝损害、心肌梗塞甚至死亡。 
另外，不管是藿香正气口服液，还是藿香正气水，具体的使用方法和剂量都需遵循说明书或医生的建议。