囊虫病的病因主要是人因吞食猪带绦虫卵而被感染，如进食生的或未熟透的猪肉，粪便中发现带状节片。本病主要通过自体感染、异体感染进行传播，好发于有吃生猪习惯的人、猪的饲养员、与猪带绦虫患者密切接触者以及排便后不注意卫生者。
吞食猪带绦虫卵，猪带绦虫卵通过自体感染或异体感染的方式进入宿主的胃、十二指肠，在消化液和胆汁的作用下钻入肠黏膜，通过小血管进入血液循环至全身各组织器官引起病变。