肩关节结核的根本预防为避免结核感染，对糖尿病等免疫力低下人群应避免接触肺结核患者，对接触过肺结核者，一旦出现全身症状，及时行结核筛查，已有结核原发病灶者，应积极治疗，对肩关节结核的预防可起到一定的作用。
（1）已有结核原发病灶存在的患者，如肺结核、消化道结核等，应积极治疗，尽早治愈，防止肩关节结核的出现。
（2）糖尿病、艾滋病、长期使用激素或免疫抑制剂者，应避免接触肺结核患者，防止感染。
（3）避免接触结核病患者，避免和结核患者共用衣服等。
（4）去往人多的地方时，应戴口罩，做好自身防护。