十二指肠良性肿瘤病因尚不明确，可能与遗传因素、胰液或胆汁的内容物刺激有关。本病好发与50～70岁成年人，暂无明确诱发因素。
1、遗传因素：部分十二指肠良性肿瘤存在家庭聚集性发病，如结肠息肉病、家族性腺瘤性息肉病、十二指肠腺瘤等，提示疾病的发生可能与遗传因素有关。
2、胰液或胆汁的内容物刺激：由于十二指肠良性肿瘤好发生于十二指肠降部，此处长期有胰液或胆汁内容物分泌，提示疾病的发生可能与胰液或胆汁的内容物刺激有关。