患有梗阻性肥厚型心肌病，首选的治疗药物为β受体阻滞剂，如美托洛尔，比索洛尔等，使用该类药物可减慢心率，增加心脏容量，有助于改善患者的症状，但是不能改善本病的预后，因为这类药没有直接消除肥厚室间隔的作用。如果患者不能耐受这类药，可以选择非二氢吡啶类药，如维拉帕米，地尔硫卓等，由于这两类药都可以减慢心率，降低心肌收缩力，所以不建议联合应用。除了药物治疗外，患者还可以进行室间隔化学消融及起搏器治疗。