乙肝的CHO疫苗和酵母疫苗再免疫效果和安全性伤并无明显的区别，临床试验结果表明两种疫苗对于新生儿免疫和乙肝母婴阻断的效果无明显差异，均具有较好的免疫和母婴阻断效果，对于新生儿的安全性也都很好。乙肝CHO疫苗是利用哺乳动物细胞基因生产的疫苗，酵母疫苗是利用酵母细胞生产的疫苗，都属于基因工程疫苗。重组酵母乙肝疫苗的优点在于生产系统操作简单，可用于大规模的工业化生产，成本较低，因此在我国的乙肝疫苗中占主要市场。从宿主亲缘性上，CHO细胞与人体更接近，因此其表达的乙肝表面抗原更接近于天然形式，产物的分离纯化也比较简单，疫苗稳定性好。但是由于哺乳动物细胞对培养条件等方面要求比较高，导致成本上升，推广受到了一定限制。有文献研究显示由于机体对疫苗的应答情况与疫苗的抗原结构有关，对于重组酵母乙型肝炎疫苗免疫后低应答或无应答者，换用高剂量的重组CHO疫苗可提高免疫成功率。