假性肠梗阻的主要治疗方法是对症支持治疗，必要时手术治疗。治疗原则是缓解临床症状，减少并发症，提供营养，维持电解质平衡，改善和恢复肠动力。
一、药物治疗
1、西沙比利：是一种新的非胆碱能刺激剂，它选择性作用于胃肠道，使其肌间神经丛释放乙酰胆碱，从而增加肌肉的收缩活动，而且避免了全身副作用，临床应用效果较好。适用于各种原因引起的胃肠道动力障碍，如胃轻瘫、假性肠梗阻、胃食管反流病及上消化道不适等。妊娠及哺乳期妇女禁用。
2、5-羟色胺受体激动剂：可诱导肠壁肌层运动神经元加速分泌乙酰胆碱和速激肽，促进肠道运动。
3、抗生素：肠内细菌过度繁殖可引起脂肪吸收不良，发生脂肪泻，用抗生素治疗可减轻症状，如红霉素具有胃动素样作用，可有效促进胃肠蠕动，治疗假性小肠梗阻有一定疗效。抗生素的选择最好是根据肠液培养的结果而定。
二、手术治疗
本病一旦确诊，原则上不施行手术。但是对症状持续存在而不能完全除外机械性肠梗阻时，剖腹探查是必要的。术中若未发现机械性肠梗阻原因时，应进行病变肠段全层切除，行组织学检查以明确性质。对不同部位病变采用不同的手术方法，当食管症状为主时，可行气囊扩张术：以胃的症状为主时，可行迷走神经切断加胃窦切除、胃空肠Roux-en-Y吻合术：若十二指肠扩张为主时，可行小肠悬吊式造瘘减压术，联合TPN效果更好。有报道小肠造瘘联合应用肠道刺激剂，对肌病性假性肠梗阻病人，可恢复其肠道平滑肌收缩能力。若病变局限于一段小肠时，可行短路术。根治性切除病变肠段是较理想的治疗。
三、其他治疗
1、全胃肠外营养：由于本病均有不同程度的吸收障碍，营养不良，加之饮食和药物治疗效果不佳，外科手术也只对一部分病人有效，因此大部分病人需要全胃肠外营养治疗，尤其是重症病人，长期全胃肠外营养治疗是维持生命的唯一方法。
2、饮食疗法：要求低脂肪、低乳糖和低纤维素饮食。因为病人的症状和体征与小肠扩张程度密切相关，而小肠扩张程度与所进食物容量和类型有关。吸收不良的脂肪可被小肠内的细菌分解为脂肪酸，它刺激小肠大量分泌，使小肠扩张。本病常伴有不同程度的小肠黏膜损伤，使乳糖的分解代谢受影响，从而使肠腔产气和液体分泌增多，加重小肠扩张。此外蠕动功能紊乱的肠袢内长期食物积聚，尤其是纤维素多的食物可形成粪石，可在假性肠梗阻的基础上产生机械性肠梗阻。因此每天提供的脂肪不超过40g，且最好为长链脂肪，乳糖不超过0.5g/100cal，纤维不超过1.5g/100cal。此外要适量补充维生素B12、维生素D、维生素K和微量元素等。急性发作时应禁食、持续胃肠减压。