膝关节滑膜炎最常就诊的科室应该是骨科，对于大型的三级甲等医院骨科分科较细，还可以分为脊柱、关节、运动和创伤外科，那么对于分科较细的可以选择就诊运动医学科或者骨关节外科。
虽然有些科室，比如康复或者中医科也会针对关节的滑膜炎进行治疗，但是涉及到外科手术的滑膜炎，最好还是就诊于骨科。入院以后医生会对患者的关节进行检查，辨明导致关节滑膜炎的具体原因，针对原因给予标准的治疗方案。
针对创伤引起的滑膜炎，比如膝关节交叉韧带和半月板损伤，可能需要采取手术治疗。
对于痛风、类风湿和骨性关节炎引起的慢性滑膜炎，可以先尝试采取保守治疗，给予非甾体的消炎药物，同时予以休息、制动，必要时行关节镜手术治疗或者行关节置换手术进行治疗。