肾盂肾炎最常见的致病菌就是大肠埃希菌，金葡菌、肺炎克雷伯菌和变形杆菌也是肾盂肾炎常见的致病菌，具体如下：
第一、肾盂肾炎的感染途径最常见的就是上行感染，通过从膀胱到输尿管，到达肾盂以后出现感染。这种感染大多数是大肠埃希菌，大肠埃希菌有菌毛，可以附着在输尿管上，然后到达肾盂，出现感染。
第二、常见的就是金葡菌，金葡菌继发于全身的感染，可以通过血行到达人体的肾盂，出现感染。
第三、肺炎克雷伯菌。
第四、变形杆菌，这些杆菌导致的肾盂肾炎，在治疗的时候通常都要求治疗的时限要够，用药至少要用7天，要给病人用10天左右，才能充分的治疗感染。