胃蛋白酶原主要由胃泌酸腺细胞合成和分泌，是胃蛋白酶的前体物质，分泌入胃腔后约有1%进入血液，其中有部分经尿排出，胃分泌胃蛋白酶原与胃泌酸能力有较强关系。
尿胃蛋白酶原可以显示胃泌酸能力及胃黏膜状态，可用于辅助诊断胃溃疡、十二指肠溃疡、胃黏膜萎缩、胃癌、甲状腺功能异常、库欣综合征、恶性贫血、垂体功能减退等疾病。