泮托拉唑适用于活动性消化性溃疡，如胃、十二指肠溃疡，反流性食管炎和卓艾氏综合征。本品通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，降低壁细胞中的H＋K＋－ATP酶的活性，从而抑制胃酸的分泌，与奥美拉唑和兰索拉唑相比，本品对细胞色素P450依赖性酶的抑制作用较弱。
在临床应用时偶有头晕、失眠、嗜睡、恶心、腹泻和便秘、皮疹、肌肉疼痛等不良症状。
泮托拉唑钠肠溶片在大剂量使用时可出现心律不齐、转氨酶增高、肾功能改变、粒细胞降低等。泮托拉唑不适用于对药品过敏者、哺乳期妇女以及妊娠头三个月妇女。