扁平疣的治疗方法临床上比较多。首先，选择外用药的治疗。其次，用物理治疗。一般选用外用药的治疗是可以应用0.05%或者是0.1的维A酸乳膏，涂1-2次/天。它主要适合于扁平疣。其他如5-氟尿嘧啶软膏、3%酞丁安、5%咪喹莫特乳膏等都可以去使用。物理办法包括冷冻、电烧以及激光的治疗，效果都是比较不错的。同时也可以是系统治疗，可以选用干扰素或者是左旋咪唑等等，都可以有效的治疗扁平疣。但是具体的治疗和选择应该到正规医院的皮肤科诊治。