腱鞘囊肿是否会痛与患者自身对疼痛的敏感程度以及囊肿张力有关。一般对疼痛越敏感，囊肿张力越大，肿块越硬，疼痛感越明显。
在临床上少部分腱鞘囊肿是可以自行消失的或者在某一个阶段不再继续长大，这种情况下可能疼痛就不明显或疼痛会随之消失。临床上腱鞘囊肿多是由于过度劳损、慢性损伤、骨关节炎以及免疫系统疾病等原因导致，多发生于手腕部、手指部和足踝部。
当怀疑有腱鞘囊肿时，应注意对局部关节进行保护，可以带护腕、护踝，进行局部热敷、理疗、按摩，同时日常生活中应注意避免关节承受较大的压力，以及尽量减少局部关节活动。