甲状腺功能减退治疗首选使用左甲状腺素钠替代治疗，甲状腺功能减退是由于各种原因，像甲状腺手术或者自身免疫炎症，或者碘-131治疗，造成甲状腺组织被损伤，合成分泌甲状腺激素不足，出现低代谢的症状，还有交感神经兴奋降低。治疗非常简单，使用左甲状腺素钠进行替代治疗，缺多少补多少。
定期进行甲状腺激素水平的测定，帮助评估激素所使用的剂量是否合适，使用的左甲状腺素钠，它的结构和自己甲状腺合成的激素结构完全一样。另外它的半衰期比较长，服用以后在血液当中浓度非常稳定，如果剂量掌握的得当就非常安全，不会影响骨骼也不会影响心脏。甲状腺功能减退，它的治疗主要是进行甲状腺激素替代治疗。