直肠炎的治疗还要根据直肠炎的具体原因而定，具体如下：
1、如果是急性腹泻引起的直肠炎，腹泻停止以后直肠炎就有自愈的倾向。
2、对于慢性直肠炎，尤其是溃疡性结肠炎的直肠型，需要系统的随访与治疗，溃疡性结肠炎的直肠型分为活动期、缓解期，在活动期往往需要美沙拉嗪的口服加灌肠治疗。严重的直肠炎有可能需要口服激素，或者激素的灌肠治疗。对于维持期可能需要美沙拉嗪栓或者美沙拉嗪口服的长期治疗。也就是溃疡性结肠炎的直肠型的治疗并不是一蹴而就的，可能需要长期的进行，短者可能需要3-5年，长的、反复发作的患者有可能需要终身的用药。应该警惕的是溃疡性结肠炎的直肠型如果不进行积极的治疗，有可能会发展成全结肠型，预后就比较差。