手足口病，尤其EV-71感染病例重的时候可引起中枢神经系统感染，多发生于病程1-5天内，表现为精神差，嗜睡，易惊，头痛，呕吐，烦躁，肢体抖动，急性肢体无力，颈项强直等脑膜炎、脑炎、脑脊髓炎症状体征。脑脊液检查为无菌性脑膜炎改变，脑脊髓CT扫描可无阳性发现，MRI检查可见异常。此期病例属于手足口病重症病例重型。