临床上强直性脊柱炎止痛的药物最常用的是非甾体类消炎药，通过抑制前列腺素的合成达到止痛，缓解病情进一步进展的作用，可以快速改善腰背部的疼痛、晨僵以及合并的关节肿痛，常用的代表药物如塞来昔布、美洛昔康、洛索洛芬钠等等。非甾体消炎药的缺点在于长期大量使用可能导致消化道溃疡，对既往有冠心病病史病人应该慎重使用。另一类控制疼痛的药物主要是阿片受体阻滞剂，在非甾类药无效时可以合并使用。另外常用的是缓解疾病的抗风湿类药物，也有一定的止痛作用，比如甲氨蝶呤、柳氮磺胺吡啶以及来氟米特等等，起到协作治疗和缓解疼痛作用。