轻微的先天性巨结肠通过采用得当的方法进行治疗后有可能被根治；而病情较严重的患者想要根治会有一定难度，但具体还是需要从患者的实际病情及后期恢复等方面来决定。该疾病在治疗上一般是采用手术治疗，手术治疗又包括过渡性手术和确定性手术。对于身体体质无法承受大手术的患者，需要先通过治疗好转后才可以进行根治性手术。术后注意预防便秘，便秘的出现是会影响到疾病恢复的。