常见的儿童先天性疾病，有以下几种：
第1、呼吸系统：常见有喉软骨发育不全、先天性的肺发育不良，还有先天性的肺部疾患。
第2、消化系统：比如先天性巨结肠症等等。
第3、循环系统：比如先天性心脏病，房间隔缺损、室间隔缺损，法洛氏四联症。
第4、血液系统：比如遗传性球形红细胞增多症，地中海性贫血缺乏症，也叫蚕豆病。
第5、先天性遗传代谢性疾病：比如肝豆状核变性、黏多糖病，先天性代谢性酶缺乏导致的一系列疾病等。
另外，还有染色体疾病，比如唐氏综合征、十八三体综合征、呆小病等，都是先天性疾病。