病毒感染性腹泻多由于进食被污染的食物或水，即通过消化道途径进行传播，日常生活中的预防应注意卫生，加强饮食和水源等管理。
1、管理传染源：对病毒感染性腹泻患者应消毒隔离，积极治疗。对密切接触者及疑似患者施行严密的观察。
2、切断传播途径：切断传播途径是预防该病的最重要而有效的措施。重视食品、饮水及个人卫生，加强粪便管理和水源保护。注意手的卫生。加强对海产品的卫生监督及海关检疫。保持良好的个人卫生习惯，不吃生冷变质食物，保证海鲜食品的加工、食用符合卫生要求。
3、提高人群免疫力：目前仅轮状病毒疫苗获准临床应用。主要用于6~12个月龄的婴幼儿，最佳接种方式是在2、4、6个月龄时口服3次。最迟在1岁内接种完成。其有效率达80%以上。免疫功能低下以及急性胃肠炎者为接种禁忌证。人乳在一定程度上可以保护严重的轮状病毒性腹泻患儿，对婴儿提倡母乳喂养。经牛轮状病毒免疫后的牝牛的牛奶中含有IgA及IgG抗体，用此种牛奶喂养婴儿也有一定的保护作用。