巧克力囊肿也就是子宫内膜异位囊肿，可能会引起患者进行性加重的痛经，并且囊肿会逐渐的增大。当囊肿增大到一定程度，可能会出现扭转或破裂，破裂后盆腹腔可能会被子宫内膜异位病灶广泛种植，出现盆腔黏连、盆腔痛、性交痛等症状，且疼痛逐渐加剧，以月经来潮前最明显。输卵管变形扭曲失去功能，患者有可能出现继发性的不孕或者是宫外孕的情况。