二代试管婴儿技术又叫ICSI，这种技术是通过注射手段将卵子和精子结合而形成受精卵注射到体内。根据循证学证据，二代试管婴儿的出生畸形率，并不高于正常受孕婴儿的畸形率。
二代试管婴儿主要是针对男性严重少精、弱精、畸精症开展的一项试管婴儿技术。试管婴儿不是精子和卵子的自然结合，而是需要挑选活动度很好的精子，直接注射到卵母细胞中形成受精卵。在注射过程中可能会造成卵子细胞浆丢失及细胞骨架、细胞器等损伤的风险。出生缺陷几率增加，可能与父母双方年龄增大有关。ICSI出生缺陷主要表现为泌尿系畸形，尽管睾丸穿刺取精数量要高于射精取精量，但是严重畸形出生率并不高于对照组。所以建议在没有指征的情况下，不必做第二代试管婴儿术。
进行二代试管婴儿移植后的患者要注意，在饮食方面多吃富含蛋白的食品。在移植后的48小时尽量保持平躺，勤观查自身情况，如果有腹痛、私处流血等症状需要及时就医。