植物神经功能紊乱通常都是在排除了患者器质性病变，或者其他明确诊断的疾病之后，才考虑给患者诊断为植物神经功能紊乱。植物神经功能紊乱会包括很多系统疾病表现，比如在神经系统、消化系统、心血管系统、泌尿系统，均可以出现植物神经功能紊乱的临床表现。
举例来说，假如患者是神经系统植物神经功能紊乱，患者存在头晕、头痛，通常是采用对症治疗作为基础治疗，对症治疗也就是在患者头痛、头晕发作的密集期，给予患者止痛治疗和治疗头晕的治疗，常用的药物包括芬必得、眩晕停等等。
如果心血管系统的植物神经功能紊乱，患者通常有可能表现为心慌，在心慌频繁发作时可以给予患者心得安、倍他乐克治疗。从以上分析可以了解到，对植物神经功能的紊乱主要是在排除器质性病变之后，针对不同的具体症状进行具体的针对性治疗。