肠道有炎症可以服用质子泵抑制剂、抗生素、止泻药物，效果比较好，肠道部位出现炎症，主要考虑是腹部着凉、细菌感染等因素引起的，通过局部防寒、保暖、热敷能起到驱寒的作用，使症状减轻。不少肠炎患者会伴有胃酸增多，为避免肠道黏膜受损，治疗时可口服质子泵抑制剂，如奥美拉唑、雷贝拉唑等一些药物，能抑制胃酸的分泌，防止胃肠黏膜受损。
肠炎治疗时还应配合抗生素类的药物，常见的有甲硝唑、阿莫西林、黄连素，能有效的杀灭肠道里面的致病菌，使患者腹泻的症状减轻。对于腹泻症状较严重的患者，还应配合口服蒙脱石散，药物里面主要的成分就是蒙脱石，能吸收肠道里面的毒素和水分，减轻患者腹泻的症状。治疗期间应多喝水，出现发热时应配合物理降温或退热药物，如布洛芬。