卡他性结膜炎属于一种过敏性结膜炎，首先可以针对过敏原进行脱敏治疗，但是一般很难找到特殊的致敏原，并且目前还没有理想的标准化脱敏制剂，所以目前的治疗方法是对症治疗，以减轻症状，预防并发症的发生为治疗原则。
一、药物治疗
1、抗组胺药物：拮抗已经释放的炎症介质的生物学活性，减轻症状，常与肥大细胞稳定剂连用。
2、肥大细胞稳定剂：通过抑制细胞膜钙通道发挥作用，最好在接触过敏原之前使用，对已经发作的患者治疗效果差，对急性恶化期无效，多用于预防发作和维持治疗。
3、糖皮质激素：治疗严重卡他性结膜炎的主要药物。短期大剂量局部激素冲击治疗是减轻激素长期副作用的关键，但长期使用糖皮质激素会有患青光眼和白内障的危险，因此一般不提倡低剂量的维持疗法，可选用比较安全的露达舒、氟美瞳等对眼压升压作用小的激素眼药水。
4、免疫抑制剂：此项治疗对于顽固的病例局部可应用。
5、人工泪液：稀释炎症机制和冲刷变应原及炎性介质的作用，长期建议使用不含防腐剂的人工泪液。
二、手术治疗
手术治疗会形成瘢痕且会导致眼睑及泪膜异常，因此对于形成盾形角膜溃疡的患者，可以考虑使用羊膜遮盖术。若形成角膜瘢痕影响视力，可考虑行角膜移植术。
三、其他治疗
卡他性结膜炎像任何特应性疾病一样，避免接触过敏原非常重要，局部冷敷可以减轻症状。