完全性阴道纵隔没有明显症状，性生活和阴道分娩无影响，不需要治疗。不完全性阴道纵隔在发生性生活时困难或出现疼痛不适，分娩时可能导致受阻，需要根据情况行阴道纵隔切除术。
一、药物治疗
 阴道纵隔无药物治疗，有症状者首选手术切除。
二、手术治疗
1、手术切除适应症：阴道纵隔影响性生活或阴道分娩，两钳之间切除纵隔，一钳钳夹膀胱侧，一钳钳夹直肠侧，从阴道口到宫颈，可用吸收线进行间断纵向缝合，以防粘连。
2、分娩时处理：当胎先露下降压迫纵隔时，先切断纵隔的中部，待胎儿娩出后再切除纵隔。