蛋白尿自愈往往是因为病人出现足细胞损伤以后，足细胞自行修复，蛋白尿就可以自愈。绝大多数蛋白尿不会自愈，经过积极治疗以后，患者尿蛋白可以消失，也可以降到能接受水平。
有部分蛋白尿患者没有经过治疗以后可自愈，最常见的是膜性肾病。膜性肾病患者因为抗原抗体复合物，对患者基底膜和足细胞造成损伤，此时会出现大量蛋白尿，但大量蛋白尿患者只要血白蛋白水平不是太低，风险通常不大。此时多会让病人观察六个月，观察六个月的过程中间，有一部分病人可以自愈，是因为基底膜把抗原抗体复合物清除，基底膜恢复到原状，足细胞也得到了恢复，滤过屏障重新建立，此时病人蛋白尿就算是自愈。