根尖周病的主要病因包括感染、刺激和创伤，好发于口腔卫生差者、龋齿未及时治疗者等人群，其他口腔疾病是根尖周病的主要诱发因素。
一、主要病因
1、感染：细菌感染是导致根尖周病发病最主要的因素，口腔卫生不好、食物嵌塞没有及时清理干净、不良修复体导致菌斑细菌聚集时，都会导致患牙发生龋洞，从而引起细菌感染，牙髓发生炎症，波及到根尖周组织引起根尖周病。
2、刺激：牙病治疗过程中使用药物不当，如牙髓组织失活剂三氧化二砷超过规定的封药时间。根管内封入刺激性大的消毒剂和甲醛甲酚，药物过量，渗透到根尖周组织中，引起根尖周病。树脂充填完后，充填材料或者粘接剂离牙髓太近。导致牙髓发生感染，长时间也会引起根尖周病。温度、激光等因素，导致患牙牙髓出现症状引起根尖周病。
3、创伤：当发生意外事故、牙齿碰撞就会遭受牙齿外伤，会出现牙齿的咬合出现问题。长时间的咬合力过大就会导致根尖周围组织承受力过大从而引起根尖周病。根管治疗时，根管器械多次超出根尖孔，质地很硬的根管充填物超出根尖孔，都是对根尖周组织的创伤因素。
二、诱发因素
其他口腔疾病：患有龋齿、慢性牙周炎、颌骨囊肿、颌骨恶性肿瘤等都能波及到根尖组织，诱发根尖周病。