腹痛是慢性胰腺炎最主要的临床症状。主要表现为上腹痛，是发作性的腹痛，放射到后背，但随着胰腺分泌功能的下降，疼痛会逐渐减轻，最终会消失。由于慢性胰腺炎导致胰腺萎缩，功能下降，最终会导致出现消化不良，脂肪泻，营养不良。另外由于胰岛的分泌功能下降，导致胰岛素分泌不足，出现糖耐量异常，并最终发展成为糖尿病。慢性胰腺炎还会造成病人出现心理方面的问题，比如焦虑、抑郁等。