阻塞性睡眠呼吸暂停低-通气综合征的发病原因和机制目前尚不完全清楚，目前认为主要有上气道解剖结构异常或病变、上气道扩张肌张力异常、呼吸中枢调节功能异常这三方面。
一、主要病因
1、上气道解剖结构异常或病变：
（1）鼻腔及鼻咽部狹窄：包括所有导致鼻腔和鼻咽部狭窄或阻塞的因素，如鼻中隔偏曲、鼻息肉、慢性鼻炎鼻窦炎、鼻甲肥大、腺样体肥大、鼻咽狭窄或闭锁等。小儿腺样体肥大可导致鼻塞、张口呼吸，可影响其颅面结构的发育，若不及时纠正，导致颅面部发育异常而使病情进一步加重。
（2）口咽腔、喉腔狭窄：腭扁桃体肥大、软腭肥厚、咽侧壁肥厚、悬雍垂过长、舌根肥厚、舌体肥大等，均可引起该部位的狭窄。由于口咽腔由软组织构成，无软骨或骨性支架，因此口咽腔狭窄在阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征发病中占有重要的地位。如婴儿型会厌、会厌组织的塌陷等喉腔狹窄也可导致。
（3）发育不良、畸形：上、下颌骨发育不良、畸形也是阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的常见及重要病因。
2、上气道扩张肌张力异常：主要表现为颏舌肌、咽侧壁肌肉及软腭肌肉的张力异常，上气道扩张肌张力降低。
3、呼吸中枢调节功能异常：主要表现为睡眠过程中呼吸驱动力降低及对高一氧化碳、高氢及低氧的反应阈值提高，此功能的异常可为原发，也可为继发。
4、全身因素或疾病：若患者存在全身性影响因素或疾病，如处于妊娠期、绝经和围绝经期，或有肥胖、甲状腺功能低下、糖尿病等问题，可诱发本病。另外，遗传因素可使阻塞性睡眠呼吸暂停-低通气综合征的发生几率增加2~4倍，饮酒、安眠药等因素可加重患者的病情。
二、诱发因素
1、肥胖：体重超过标准体重的20%以上，即体重指数大于28kg/m^2。
2、年龄：成年后随着年龄增加，患病率增加，女性绝经期后患病者增多。
3、长期大量饮酒、吸烟：长期大量饮酒者发生阻塞性睡眠呼吸暂停-低通气综合征风险较高。
4、高血压：该病容易继发于高血压，患者常主诉打鼾以及白天嗜睡。
5、家族史：本病具有一定的遗传性和家族聚集性，如儿童腺样体过度增生、咽扁桃体肥大等因素具备一定的遗传倾向，家族中有患者时，患病风险可提高。
6、上气道结构异常：若存在鼻中隔偏曲、鼻甲肥大、腺样体增生、舌体肥大、咽腔狭窄等问题，也会导致气道不顺畅，最终引起本病。