线粒体脑肌病从实质上讲没有特殊的治疗方法无法根治，尽管临床上有很多的治疗方法，只能从一定程度上缓解病情，并不能阻止病情的进展。常用的治疗方法包括两方面：第一就是采用一些抗氧化剂对症治疗，比如辅酶Q10、艾地苯醌、B族维生素等。第二就是对症治疗。如果有癫痫要给予抗癫痫的药物治疗，发生糖尿病要注意降糖。