短暂性脑缺血并发房颤的治疗药物主要有以下几种：
1、抗凝剂，可以用来预防中风，例如可以使用华法林钠片。如果服用华法林钠片的风险相对较高，可以使用替代药物，如利伐沙班片、达比加群酯胶囊。
2、如果患者摄入不足，应给予补液治疗，如静注羟乙基淀粉40氯化钠注射液或补充维生素C，增加血管密度，调节胆固醇代谢等。
3、患者应治疗房颤，如果心室率较快，应给予盐酸胺碘酮片以降低心室率。如果患者的心室率正常，则以抗凝治疗为主。