治疗肥厚型心肌病无特效药。目前治疗主要是改善症状，减少并发症和预防猝死的发生。常用药物有：1.β受体阻滞剂：使心肌收缩减弱，从而减轻流出道梗阻，减少心肌氧耗，如普萘洛尔。2.选用钙离子拮抗剂：具有负性肌力作用，减弱心肌收缩，如维拉帕米。3.抗心律失常药物，控制快速室性心律失常与心房颤动，如胺碘酮。4.对于晚期已有心室收缩功能损害者，出现充血性心力衰竭者，给予抗心衰药物，如地高辛、螺内酯、速尿等。