甲亢性心脏病治疗的关键是控制甲亢，同时治疗心血管的并发症。甲亢可以通过药物，放射碘、手术进行治疗，其中药物治疗应用最广。甲亢心脏病的治疗要对症处理，房颤给予抗心律失常药，心衰给予强心利尿，心绞痛给予扩血管治疗。
一、一般治疗
适当休息、注意补充足够热量和营养，包括糖、蛋白质和B族维生素等，精神紧张、不安或失眠较重者，可给予苯二氮䓬类镇静药。
二、原发病治疗
甲亢性心脏病的治疗效果，关键在于早期诊断、尽快控制甲亢。对甲亢本身的治疗一般分为抗甲状腺药物、甲状腺次全切除术和放射性碘治疗。
1、药物治疗：常用的药物有甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶、甲硫氧嘧啶，一般选用其中的一种。
2、放射性碘治疗：一般原则是，对甲亢性心脏病，尤其是伴有器质性心脏病的甲亢，为了防止复发，主张用放射性碘治疗；对老年病人，当抗甲状腺药物治疗不佳时，或病情较重时，可选用碘治疗；对曾一次或数次行甲状腺切除术，而甲亢复发的病人，碘治疗更为合适。而年龄较小，尤以20岁以下的病人，以及孕妇或有甲状腺癌可能者，则不宜使用。
3、外科手术：一般采用甲状腺次全切除术，施行甲状腺手术前病人有心脏征象，并不足以成为禁忌症，即使合并心绞痛，也不是手术的绝对禁忌症，凡疑是甲状腺癌者应施行手术。此外，向胸腔扩展的甲状腺肿(胸骨后甲状腺肿)和有压迫症状者，也应考虑手术治疗。手术前病人应先服用抗甲状腺药物，以改善临床症状，降低基础代谢率。施行手术前还可根据需要给予碘/碘化钾(复方碘溶液)或普萘洛尔等药物。
三、药物治疗
1、甲亢合并心力衰竭的治疗：一般原则为减轻心脏负荷，增加心肌收缩力，减少水钠潴留。首先应卧床休息，限制钠盐和水的摄入，间断吸氧，必要时选用强心苷、利尿剂。若应用强心苷、利尿剂，心衰控制不满意或病情较重时，可使用肾上腺皮质激素，口服泼尼松，必要时可静滴氢化可的松，或与利尿剂同时应用。
2、甲亢合并心房纤颤的治疗：如甲巯咪唑与强心苷和抗心律失常药物合用，尤其是钾盐和β受体阻滞剂合用，常可使快速性房颤转为慢性房颤或恢复窦律。对于甲状腺功能正常后15周仍有持续性房颤者，伴有其他器质性心脏病，或虽未发现心脏病，房颤在1年以上者，均应做心律转复。药物转复可用奎尼丁、维拉帕米、普萘洛尔等。对甲亢控制后持久顽固的房颤，亦可行电击转复，以后再用小量奎尼丁维持。如患者原来应用洋地黄，电转复前必须停用。
3、甲亢性心脏病发生心绞痛的治疗：甲亢性心绞痛也可能在有效治疗甲亢后消失，某些病人适当应用扩冠药物也能改善心绞痛症状。
4、危重型甲亢性心脏病的治疗：甲巯咪唑合用利舍平、安他唑啉，心率降至70~100次/分，逐渐减量；必要时用地尔硫䓬；中等量镇静药，间断吸氧，积极抢救和预防心衰、心绞痛和心肌梗死也至关重要。
5、β受体阻滞剂的应用：不主张用强心苷治疗甲亢病人的心动过速，在这种情况下，宜采用儿茶酚胺阻滞剂，如β受体阻滞剂治疗。但必须在抗甲状腺药物治疗过程中，针对心动过速、室上性心律失常以及甲亢的焦虑、震颤、心悸等症状而协同应用，可以缩短治疗时间和减少各自的用药剂量。通常抗甲状腺药物效应出现在用药后3~4周，若同时应用 β受体阻滞剂则效应显著提前，并提高疗效。普萘洛尔较适合老年甲亢和并发其他心脏病的年轻人甲亢，也用在术前准备阶段(并可防止术后危象发生)，以及甲状腺放射性核素碘治疗的准备阶段。
四、手术治疗
部分甲亢合并房颤病人经手术治疗后常能获得满意的治疗效果，但有些手术后仍有顽固性心房纤颤病人，多合并严重心功能不全。术后2~3周后效果不佳者，需做心律转复。