甲钴胺临床有口服片剂和注射剂两种剂型。甲钴胺片剂作为口服制剂有副作用，只是它的副作用较注射剂相对比较轻微，最主要的是胃肠道反应，偶见食欲不振、恶心、呕吐和腹泻，少见有皮肤过敏反应。临床主要用于周围神经病变，以及维生素B12缺乏引起的巨幼细胞性贫血的治疗。一般来说如果服药一个月后症状还没有明显的改善，则无需继续服用。
对于从事与汞及其化合物有关工作的工作人员，因为甲钴胺转甲基的作用，可将汞转化为甲基汞及有机汞，有机汞的脂溶性强，较易进入生物体内聚集，引起汞中毒，因而不宜长期大量服用。对于孕妇及哺乳期妇女要慎用，对于老年人，由于老年人机体机能减退，建议可以在医生指导下酌情地减量使用。