新生血管性青光眼的治疗要针对病因治疗，视网膜缺氧和毛细血管无灌注是虹膜新生血管形成的根源，因此对视网膜缺血现象应尽早采用全视网膜激光光凝术或全视网膜冷凝术，以预防虹膜新生血管的形成和青光眼的发生。当患者发生新生血管性青光眼时，加用降眼压药物治疗，行滤过性手术并加抗代谢药物，或人工引流装置植人手术。对于眼压不能控制且已无有用视力的终末期或绝对期新生血管性青光眼患者，减轻眼痛等症状是主要治疗目的。
一、药物治疗
1、局部用药：局部用0.5%噻吗洛尔滴眼液滴眼，局部散瞳及滴用激素类眼液可有止痛效果。
2、全身用药：为了降低眼压，可口服醋氮酰胺以减少房水生成，亦可口服甘油、异山梨醇及静脉滴注高渗剂等。
3、眼内注药：玻璃体腔注射抗血管内皮细胞生长因子药物，可以有效改善视网膜缺血及消除眼前段新生血管，对防止术中术后前房出血和延长滤过泡寿命也有一定作用。
二、手术治疗
1、滤过性手术：施行滤过手术前，要详细查房角，选择少或无新生血管的部位手术。若有新生血管，应先行氟激光光凝，将房角新生血管封闭。待新生血管消退后，可根据患者青光眼的程度及个人手术技巧，来选择术式。
如：巩膜下咬切、小梁切除术、青光眼引流阀植入术等。手术中根据患者的青光眼程度、结膜厚度、年龄大小、新生血管多少等，决定应用滤过性手术后的部位、范围及时间。Palmer认为术中应用滤过性手术，眼压控制的总有效率占84%，成功的特点是可以形成大而隆起的无血管的功能性滤过泡。
2、Ahmed青光眼阀植入术：青光眼房角开放期多采用各种房水引流装置放入眼内，这些都是对组织反应小，组织适应性好的合成高分子化合物。1969年Moltemo首先介绍青光眼引流管植入治疗难治性青光眼，之后临床上进行了大量的研究不断改进，现在常使用改良Molteno，Ahmed，Krupin等几种植入物。手术成功率多在50%~80%之间，术中、术后联合应用抗组织瘢痕药物(MMC、5-FU等)，使手术成功率大大提高。
三、其他治疗
1、全视网膜光凝术：
（1）全视网膜光凝术的目的在于保护黄斑不受累及，光凝破坏新生血管区，封闭新生血管及供养血管，并促进视网膜出血、水肿及渗出的吸收，停止释放血管生长因子，预防再有新生血管形成及其他并发症的发生。可用氩激光(波长4880nm)和氮红激光(波长647.1nm)，屈光间质混浊者首选氮红激光。
（2）全视网膜光凝可根据眼底病变程度于2周至1个月内分3-4次完成，积累治疗量1500-2500点。疗效随光凝面积的增加而提高。经研究报告94%的视网膜、虹膜、房角新生血管在2~4周内消退。
2、全视网膜冷凝术：对于眼底可视性不好及行全视网膜光凝术有困难的患者，可以行全视网膜冷凝术。掌握好全视网膜冷凝手术技巧，可以有效地使新生血管消退，而不引起视力减退。方法：沿角膜缘一圈剪开球结膜，分离至赤道部，四条直肌做牵引缝线。距角膜缘7mm、10mm，13mm各冷冻一排，每排冷冻约20~24个点。10~0尼龙线间断缝合球结膜。有研究报告，治疗后数天至1周新生血管开始消退，1个月基本可以完全消退。