单纯的新生儿肺炎治愈后不易复发。如果新生儿合并有先天性呼吸道畸形如支气管肺发育不良、气管软化及胸廓畸形，或者合并有先天性免疫功能低下，具有以上情况的新生儿肺炎治愈后会经常复发。另外，小于胎龄早产儿、低出生体重儿及后天营养不良的小婴儿，容易出现肺炎，治疗较困难且容易复发。加强孕期保健，减少早产儿及先天性畸形儿的出生，能有效降低新生儿难治性复发性肺炎的出现。