小孩子反复高烧39℃以上，最常见的可能是感染性的因素造成的，比较常见的可以是病毒感染，也可以是细菌感染。流感病毒或者是一些腺病毒、呼吸道合胞病毒感染，都可能引发出现高热情况，这种疱疹病毒也会引起高热反应。这个时候首先要知道病毒感染的类型，相应的进行适当的处理。
还有些高热可能与细菌感染有关，像比较常见的扁桃体化脓或者扁桃体发炎，这种一般是溶血性链球菌感染为主进行的感染，需要进行抗炎治疗才能缓解。当然还有些反复高热可能与像川崎病或者EB病毒感染，都能造成出现反复发热。当然也有些风湿、类风湿或者血液疾病，也会出现反复发热39℃以上的情况。所以引起发热的病因很复杂，可以是感染因素，也可以是非感染因素，需要结合临床症状及相关检查才能判断。