急性肺栓塞的病因包括原发性因素和继发性因素，多继发于静脉血栓栓塞症，发生风险与年龄增加有关，好发于好年人、呼吸衰竭患者、急性感染性疾病患者、骨折术后患者等。
一、主要病因
1、原发性危险因素由遗传变异引起，包括V因子突变、蛋白C缺乏、蛋白S缺乏和抗凝血酶缺乏等，常以反复静脉血栓形成和栓塞为主要临床表现。40岁以下的年轻患者如无明显诱因或反复发生该疾病，或发病呈家族聚集倾向，应注意做相关原发性危险因素的检查。
2、继发性危险因素是指后天获得的易发生静脉血栓栓塞症的多种病理和病理生理改变。包括骨折、创伤、手术、恶性肿瘤和口服避孕药等。上述危险因素既可以单独存在，也可同时存在、协同作用。年龄是独立的危险因素，随着年龄的增长，发病率逐渐增高。
二、诱发因素
1、血流淤滞：常见于老年、久病卧床、下肢静脉曲张、肥胖、休克、充血性心力衰竭等病人，或妊娠妇女、卒中瘫疾、中心静脉置管等。
2、静脉管壁损伤：如外科手术、肿瘤、烧伤、糖尿病等。
3、高凝状态：见于肿瘤、真性红细胞增多症、严重溶血性贫血、脾切除术后血小板溶解、高胱氨酸尿症、口服避孕药等。
4、其他：重大创伤、下肢骨折、关节置换和脊髓损伤、膝关节镜手术、自身免疫疾病、炎症性肠道疾病等。