手足口病的症状，一般潜伏期有3-7天，多数突然起病。大约有一半的患者在发病前1-2天或发病时有中、低热，体温在38℃左右伴乏力，可出现喷嚏、咳嗽、流鼻涕等感冒样症状，类似于感冒，也可出现食欲减退、恶心、呕吐、腹痛等胃肠道症状。
手足口病患者有症状比较轻微的轻症病例，还可能有症状较重的重症病例，其表现如下：
1、轻症病例：在发病期以手、足、臀皮疹以及口痛为特征，由于口腔痛、口咽痛影响进食，婴儿可表现为流涎拒食。口腔黏膜疹出现比较早，起初为粟粒样斑丘疹或者水疱，周围伴有红晕，主要是位于舌及两颊部或者口唇。手、足等远端部位，还有臀部、躯干和四肢成簇出现或平或凸的斑丘疹或疱疹，无痛、瘙痒。斑丘疹在5天左右就由红变暗，然后消退。疱疹呈圆形或椭圆形扁平凸起，内部可有浑浊液体，长径与皮纹走向一致，一般在5-10天结硬皮并逐渐消失，不留痕迹；
2、重症病例：此病例比较少，少数病例尤其是7-12个月的患儿，病情进展比较迅速，在发病1-5天出现脑膜炎、脑炎、脑脊髓炎、肺水肿、循环障碍等，极少数病例病情危重可导致死亡，存活的病例可留有后遗症。