根据病变发生的部位可分为以下三种：
1、原发性甲减：原发性甲减是由于甲状腺腺体本身病变引起的甲减，占全部甲减的95%以上，且原发性甲减主要是由自身免疫、甲状腺手术和甲亢Ⅰ治疗所致。
2、中枢性甲减：中枢性甲减由下丘脑和垂体病变引起的促甲状腺激素释放激素，或者促甲状腺激素产生和分泌减少所致的甲减，垂体外照射、垂体大腺瘤、颅咽管瘤及产后大出血是其较常见的原因；其中由于下丘脑病变引起的甲减称为三发性甲减。
3、甲状腺激素抵抗综合征：甲状腺激素抵抗综合征是由于甲状腺激素在外周组织实现生物效应障碍引起的综合征。