目前认为软组织肿瘤病因不明，可能与遗传、先天畸形、异物刺激、化学药物刺激及内分泌失调等有关，其致病因素较为复杂，一般不会呈现单一性。
一、主要病因
1、遗传因素：遗传因素是重要的致病因素之一，染色体异常的人其肿瘤发病率高于正常人，并可能会出现家族遗传现象。
2、先天畸形：先天畸形的患者常常在婴幼儿时期最容易发病，比如临床上最常见的血管瘤的发生。
3、异物刺激：长期对局部组织的刺激，可能会导致局部组织发生病理性变化。
4、内分泌失调：软组织肿瘤的发生可能与内分泌失调有关，但其具体研究机制目前尚不明确。
5、化学药物刺激：经动物实验，现已证实多环碳氢化合物具有诱发作用，但对人体尚缺乏有力的证据，仅从流行病学的调查中发现少数长期接触聚氯乙烯的工人，会发生肝血管肉瘤。
6、创伤：有相当一部分软组织肿瘤患者的肿瘤部位有过明确的外伤史，有些患者是在手术瘢痕的基础上发生软组织肿瘤，常见的瘢痕疙瘩就是最明显的证据。
二、诱发因素
1、病毒、慢性水肿性炎症及放射线因素可诱发软组织肿瘤。
2、饮食因素：脂肪瘤的患者，饮食因素是极为重要的诱因之一，长期过量服用含脂肪量较高的食物，会极大的增加患脂肪瘤的几率。